Show simple item record

dc.contributor.authorLach, Jakub
dc.date.accessioned2023-09-06T07:16:29Z
dc.date.available2023-09-06T07:16:29Z
dc.date.issued2023
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11089/47858
dc.description.abstractCelem przedstawionej pracy doktorskiej było scharakteryzowanie bioróżnorodności mikrobiomów wybranych środowisk o wysokim zasoleniu oraz ocena potencjału biotechnologicznego bytujących w nich mikroorganizmów w oparciu o dane genomiczne i metagenomiczne. Wygenerowane dane oraz przeprowadzone analizy pozwoliły na ocenę składu taksonomicznego mikrobiomu Kopalni Soli Bochnia oraz na identyfikację klastrów genów związanych z biosyntezą wtórnych metabolitów. Ponadto w analizowanych metagenomach zidentyfikowano 16 unikatowych MAGs, z których 15 nie ma swoich odpowiedników wśród dotychczas znanych sekwencji. W toku analiz zsekwencjonowano również genomy pięciu szczepów Eubakterii oraz trzech szczepów Archaea wyizolowanych z solanek pobranych na obszarze Przedgórza Karpackiego. Część z genomów należy najprawdopodobniej do nowych, nieopisanych dotychczas gatunków. W dalszej kolejności na podstawie danych metagenomicznych wytypowano trzy sekwencje, które potencjalnie mogły kodować peptydy przeciwdrobnoustrojowe. Zostały one zsyntezowane a ich właściwości zostały ocenione w warunkach laboratoryjnych. Wykazano, że peptyd P1 był aktywny przeciw E. faecalis 29212 a peptyd P3 przeciw E. faecalis 29212 i S. aureus 43300. Ponadto udowodniono, że oba analizowane peptydy nie mają właściwości cytotoksycznych ani nie wykazują aktywności hemolitycznej. Podsumowując, w toku prac scharakteryzowano mikrobiom Kopalni Soli Bochnia oraz genomy szczepów mikroorganizmów wyizolowanych z solanek pobranych na obszarze Przedgórza Karpackiego. Ponadto wykazano, że wybrane peptydy kodowane w analizowanych metagenomach wykazują aktywność przeciwdrobnoustrojową i mogą być obiektem dalszych badań mających na celu ocenę możliwości wykorzystania ich w praktyce.pl_PL
dc.description.sponsorship"InterDOC-STARt – Interdyscyplinarne Studia Doktoranckie na Wydziale BiOŚ UŁ” - Program Operacyjny Wiedza Edukacja Rozwój 2014-2020, Oś priorytetowa III. Szkolnictwo wyższe dla gospodarki i rozwoju, Działanie 3.2 Studia doktoranckie. Nr projektu: POWR.03.02.00- IP.08-00-DOK/16. Realizowany w latach 2018-2022. Kierownik – prof. dr hab. Agnieszka Marczak.pl_PL
dc.language.isoplpl_PL
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Międzynarodowe*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectMetagenomikapl_PL
dc.subjectHalofilepl_PL
dc.subjectMikrobiologia środowiskowapl_PL
dc.titleCharakterystyka bioróżnorodności i potencjału biotechnologicznego mikroorganizmów halofilnychpl_PL
dc.typePhD/Doctoral Dissertationpl_PL
dc.page.number141pl_PL
dc.contributor.authorAffiliationUniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska, Katedra Mikrobiologii Molekularnejpl_PL
dc.dissertation.directorStączek, Paweł
dc.dissertation.directorMatera-Witkiewicz, Agnieszka
dc.dissertation.reviewerKalwasińska, Agnieszka
dc.dissertation.reviewerKamysz, Wojciech
dc.dissertation.reviewerBartosik, Dariusz
dc.date.defence2023-11-07
dc.disciplinenauki biologicznepl_PL


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Międzynarodowe
Except where otherwise noted, this item's license is described as Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Międzynarodowe