http://hdl.handle.net/11089/2 2026-05-19T14:55:47Z http://hdl.handle.net/11089/58348 Nowe metody znakowania związków o znaczeniu biologicznym znacznikami fluorescencyjnymi i metalokarbonylowymi Koprowska, Karolina Wraz ze wzrostem rozwoju i szybkim tempem życia wzrasta zachorowalność na choroby cywilizacyjne, w tym na choroby nowotworowe. Przekłada się to na poszukiwanie nowych rozwiązań w leczeniu jak i monitorowaniu procesów zachodzących w żywych organizmach. Wiąże się to z poszukiwaniem szybkich, tanich i nieinwazyjnych metod diagnostycznych. W ramach doktoratu przeprowadzone zostały badania nad nowymi znacznikami, które w przyszłości mogą znaleźć zastosowanie zarówno w znakowaniu biomolekuł i leków jak również w diagnostyce medycznej oraz bioobrazowaniu. W pierwszej kolejności zbadano znaczniki metalokarbonylowe, łatwe do detekcji w spektroskopii IR. Związki te zawierały w cząsteczce fragmenty (di)bromomaleimidu, które łatwo reagują z biomolekułami, w których strukturze występują grupy -SH. W pracy zastosowano jedną z metod modyfikacji protein, gdzie w mostek dwusiarczkowy wbudowana została pochodna maleimidu (rebridging). Otrzymane w ten sposób metalokarbonylowe pochodne ditiomaleimidu, pod wpływem naświetlania światłem widzialnym, tracą fragment metalokarbonylowy i przekształcają się w N-niepodstawione pochodne ditiomaleimidu, które wykazują fluorescencję. Z badań biologicznych wynika, że pochodne metalokarbonylowe, wykazują aktywność cytotoksyczną w stosunku do komórek nowotworowych, natomiast ich analogi, nie zawierające fragmentu metalokarbonylowego, nie były toksyczne. Badania z wykorzystaniem mikroskopu konfokalnego, sugerują, że metalokarbonylowe pochodne łatwiej przedostają się do wnętrza komórki niż ich organiczne odpowiedniki. Opracowane metody syntetyczne pozwoliły również na otrzymanie znaczników fluorescencyjnych zawierających fluorofor pirenowy oraz aktywny w reakcjach typu „click” układ cyklooktynowy. Ze względu na ciekawe właściwości fotofizyczne w roztworach, jaki i w ciele stałym, związki te mogą zostać zastosowane jako znaczniki fluorescencyjne. Obecność fragmentu cyklooktynowego w cząsteczce sprawia, że związki te ulegają reakcjom bioortogonalnym, co zostało wykorzystane do bezpośredniej modyfikacji biocząsteczek, a otrzymane koniugaty wykazywały silną fluorescencję. Ponadto, z przeprowadzonych badań biologicznych wynika, że związki te, nie są toksyczne zarówno dla komórek prawidłowych, jak i nowotworowych, mogą zatem stanowić bezpieczną alternatywę dla znaczników izotopowych. Została podjęta również próba modyfikacji układu maleimidowego za pomocą pirenu i jego tiopochodnej. Otrzymane pochodne (di)tiomaleimidu z pirenem nie wykazywały właściwości luminescencyjnych.; As modern life becomes increasingly fast-paced, the number of civilization-related diseases, including cancer, continues to rise. This situation drives the search for new solutions to treat diseases, but also to monitor biological processes occurring in living organisms. As a result, scientists are particularly interested in developing diagnostic methods that are fast, affordable, and non-invasive. The main aim of this doctoral research focused on the development of new markers that may find applications both in the labeling of biomolecules and drugs, as well as in medical diagnostics and bioimaging. The first part of the research focused on the investigation of metal carbonyl markers, which can be easily detected using infrared (IR) spectroscopy. These compounds contain (di)bromomaleimide fragments which readily react with biomolecules possessing thiol groups. One of the protein modification strategies which was applied in this work involves the incorporation of a maleimide derivative into a disulfide bridge – a process known as rebridging. Metal carbonyl dithiomaleimide compounds undergo an interesting transformation during irradiation with visible light - they lose the metal carbonyl part and turn into non-substituted dithiomaleimide derivatives which emit fluorescence. Biological studies showed that the metal carbonyl compounds are toxic to cancer cells, while their organic analogues are not cytotoxic. Confocal microscopy studies suggest that compounds containing the metal carbonyl unit enter/ penetrate cells more easily than their purely organic analogues. The synthetic methods developed in this work also enabled to obtain fluorescent markers containing a pyrene fluorophore and a cyclooctyne group capable of participating in so-called “click” reactions. These compounds show attractive photophysical properties both in solution and in the solid state, making them promising fluorescent probes. Due to the presence of the cyclooctyne fragment, these markers can undergo bioorthogonal reactions - highly selective chemical reactions that take place inside biological systems without disturbing them. This property was successfully used for the direct labeling of biomolecules, producing strongly fluorescent conjugates. Moreover, biological studies indicate that these compounds are non toxic to both normal and cancer cells, and thus may represent a safe alternative to isotopic labels. Finally, the study also included modifications of the maleimide ring using pyrene and its sulfur/thiol derivative. However, the resulting pyrene-substituted (di)thiomaleimide derivatives did not exhibit luminescent properties. 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/11089/57802 Photochemical synthesis of carbazole-fused Blatter radicals: effective spin injection to the carbazole system Bartos, Paulina; Szamweber, Patrycja; Camargo, Bruno; Pietrzak, Anna; Kaszyński, Piotr Photocyclization of N-substituted carbazole derivatives of benzo[e][1,2,4]triazine gave two carbazole-fused Blatter radicals with a novel heterocyclic skeleton. No photocyclization was observed for the analogous dibenzocarbazole, indole, benzimidazole, and phenoxazine precursors, which was rationalized with DFT computational methods. The two carbazole-derived radicals were characterized by spectroscopic (UV- vis, EPR) and electrochemical methods, while one of them was analyzed structurally (XRD) and magnetically (SQUID). The latter analysis revealed ferromagnetic interactions in the solid state with 2J/kB = 16.6 K. Properties of these first examples of a new class of stable radicals were analyzed with DFT methods, which confirmed significant impact of the peri-nitrogen atom on electronic properties and additional 15% spin delocalization. 2025-05-27T00:00:00Z http://hdl.handle.net/11089/57801 Ladder-Type Cu(II) Coordination Polymer with π−π Stacking of Planar Blatter Radical Ligands: Structural and Magnetic Characterization Singh, Hemant K.; Smith, Kayla M.; Rawson, Jeremy M.; Camargo, Bruno; Pollett, Ethan S.; Hietsoi, Oleksandr; Friedli, Andrienne C.; Kaszynski, Piotr The synthesis of two C(2)-pyridyl derivatives of the planar Blatter radical was developed by using the tris(trimethylsilyl)silane (TTMSS)-assisted cyclization of appropriate iodoarenes. These monodentate paramagnetic ligands were characterized by spectroscopic (UV−vis and electron paramagnetic resonance (EPR)) and electrochemical methods and reacted with (pdc)Cu(H2O)3. A complex containing the 3-pyridyl group was characterized structurally, revealing novel polymeric Cu−O−Cu−O ladders separated with slipped stacks of radical ligands. Superconducting quantum interference device (SQUID) magnetometry of this complex demonstrated strong antiferromagnetic interactions between the radicals and largely isolated Cu(II) ions. Analysis of the magnetic data with the Hatfield model, assuming two isolated one-dimensional (1D) alternating Heisenberg chains, gave JRR/kB = −1200 K and αRR = 0.4 for the paramagnetic ligand stacks, and JCuCu/ kB = −3.5 K and αCuCu = 0.9 for the Cu(II) ion chains. Analysis of the experimental data was augmented with density functional theory (DFT) calculations. 2025-09-17T00:00:00Z http://hdl.handle.net/11089/57734 Dataset for publication_Molecules 2025(30)4651_funded by National Science Center, Poland 2021/41/N/ST4/01425 Koszelska, Kamila; Świderski, Michał; Seroka, Jagoda; Guziejewski, Dariusz; Krzymiński, Paweł; Miniak-Górecka, Alicja; Ullah, Nabi; Smarzewska, Sylwia The study focused on evaluating the effect of electrode surface preparation on electrochemical measurements. In particular, the influence of different polishing protocols applied to carbon electrodes was investigated with respect to the electroactive surface area and the repeatability of the electrochemical response. The mechanical cleaning procedure of the solid disc electrode was systematically examined by testing various polishing motions and numbers of repetitions. The results demonstrated that the polishing method significantly affects both the electroactive surface area and measurement repeatability. The highest surface area and best repeatability were achieved using an “8-shaped” polishing motion. These findings confirm that electrode surface preparation plays a critical role in obtaining reliable and reproducible electroanalytical data. Dane badawcze powiązane z publikacją: Publikacja1. Świderski, M.; Seroka, J.; Guziejewski, D.; Krzymiński, P.; Miniak-Górecka, A.; Koszelska, K.; Ullah, N.; Smarzewska, S. Influence of Electrode Polishing Protocols, Potentiostat Models, and LOD Calculation Methods on the Electroanalytical Performance of SWV Measurements at Glassy Carbon Electrodes. Molecules 2025, 30, 4651. https://doi.org/10.3390/molecules30234651 In the file, measurement data obtained during voltammetric studies are provided. They present analyses carried out using different potentiostats, as well as various electrode surface renewal (cleaning/polishing) methods. 2025-01-01T00:00:00Z